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 ue-methodes-et-ressources-pour-ladaptation-en-domaine/
SUMMARY:Extraction d'information clinique : méthodes et ressources pour l'
 adaptation en domaine
DESCRIPTION:Jury\nPascale Sébillot\, Professeure des Universités\, INSA R
 ennes\, IRISA – Rapporteure\nRosy Tsopra\, Maîtresse de Conférences de
 s Universités\, Praticienne Hospitalière\, Université Paris-Cité\, AP-
 HP – Rapporteure\nBenoît Favre\, Professeur des Universités\, Aix-Mars
 eille Université\, LIS – Examinateur\nVincent Guigue\, Professeur des U
 niversités\, AgroParisTech – Examinateur\nAntoine Neuraz\, Chercheur\, 
 Stane – Examinateur\nRésumé\nLes systèmes de santé modernes produise
 nt quotidiennement d’importants volumes de données cliniques non struct
 urées (des textes comme les comptes rendus d’hospitalisation\, lettres 
 de sortie\, résultats d’examens)\, qui sont riches en informations esse
 ntielles pour le suivi des patients\, la recherche médicale et la santé 
 publique. Toutefois\, la diversité linguistique\, la complexité sémanti
 que et les contraintes de confidentialité limitent fortement l’exploita
 tion automatique de ces textes\, en particulier en langue française. L’
 extraction d’information clinique à partir de ces documents demeure ain
 si un défi majeur\, surtout dans un contexte où les corpus annotés sont
  rares et les protocoles d’évaluation établis ne sont pas toujours app
 licables et standardisés. Cette thèse se positionne à l’intersection 
 de l’informatique médicale et du traitement automatique des langues (TA
 L)\, et cible spécifiquement les documents cliniques francophones. Elle e
 xplore la reconnaissance d’entités nommées (REN) et le résumé automa
 tique de dossier patient en contexte d'urgence. Afin de répondre aux déf
 is méthodologiques\, techniques et évaluatifs propres à l’extraction 
 d’information en français\, la thèse s’articule autour de quatre axe
 s de recherche : le manque de corpus annotés\, l’adaptation des modèle
 s de langues généralistes au domaine clinique\, l’évaluation rigoureu
 se dans des contextes hospitaliers réels\, et l’identification des scé
 narios d’usage adaptés aux grands modèles de langues. Les résultats o
 btenus montrent que\, pour la reconnaissance d’entités cliniques\, dans
  un contexte où il y a peu de corpus annotés disponibles en français\, 
 les modèles de langues masqués affinés surpassent nettement les grands 
 modèles génératifs\, aussi bien en termes de performance qu’en impact
  environnemental. L’apprentissage actif appliqué à la sélection d’e
 xemples permet\, en outre\, de réduire considérablement le coût d’ann
 otation sans perte significative de performance. Concernant le résumé de
  dossier patient\, une approche RAG associant récupération symbolique de
 s passages pertinents et génération automatique par LLM permet d’obten
 ir des synthèses à la fois cliniquement pertinentes et robustes\, contri
 buant ainsi à une amélioration de l’accessibilité de l’information 
 critique pour la prise en charge rapide des patients. Ces contributions so
 nt évaluées à l’aide de protocoles reproductibles\, intégrant des m
 étriques classiques\, des analyses humaines qualitatives\, et la mesure d
 e l’impact environnemental. Au-delà des avancées méthodologiques\, ce
 tte thèse invite à une intégration critique\, transparente et contextua
 lisée du TAL dans le domaine médical. Elle souligne les risques d’une 
 confiance excessive envers des systèmes opaques dits « IA »\, l’impor
 tance de la confidentialité des données\, les coûts environnementaux et
  sociétaux du TAL à grande échelle\, et la nécessité d’une gouverna
 nce et d’une documentation rigoureuses pour les applications en santé. 
 Les travaux réalisés ouvrent la voie vers une extraction d’information
  clinique francophone plus fiable\, durable et équitable\, avec des persp
 ectives étendues aux langues et contextes dans lesquels peu de corpus ann
 otés sont disponibles.
CATEGORIES:STL,Thèses et HDR
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