Bio-Informatique, Biologie Systémique

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  • Communication dans un congrès

    Ferdinand Petit, Jérémy Guez, Fanny Pouyet, Bruno Toupance, Evelyne Heyer, et al.. Topological comparison of coalescent tree inference tools.. Congress of the European Society for Evolutionary Biology, Aug 2022, Prague (Czech Republic), Czech Republic. ⟨hal-03970653⟩

    BioInfo

    Année de publication 2022

  • Communication dans un congrès

    Alexandra Zaharia, Bernard Labedan, Christine Froidevaux, Alain Denise. Heterogeneous Graph Mining for Biological Pattern Discovery in Metabolic Pathways. SeqBio 2016, Nov 2016, Nantes, France. ⟨hal-01745390⟩

    BioInfo

    Année de publication 2016

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  • Article dans une revue

    Kevin Caye, Flora Jay, Olivier J.J. Michel, Olivier François. Fast Inference of Individual Admixture Coefficients Using Geographic Data. Annals of Applied Statistics, Institute of Mathematical Statistics, 2018, 12 (1), pp.586-608. ⟨10.1214/17-AOAS1106⟩. ⟨hal-01676712⟩

    AO

    Année de publication 2018

    Disponible en libre accès

  • Article dans une revue

    Mikael Trellet, Nicolas Ferey, Jakub Flotyński, Marc Baaden, Patrick Bourdot. Semantics for an Integrative and Immersive Pipeline Combining Visualization and Analysis of Molecular Data. Journal of Integrative Bioinformatics, Informationsmanagement in der Biotechnologie e.V. (IMBio e.V.), 2018, 15 (2), ⟨10.1515/jib-2018-0004⟩. ⟨hal-01935586⟩

    Année de publication 2018

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  • Thèse

    Sanjay Kamath Ramachandra Rao. Question Answering with Hybrid Data and Models. Document and Text Processing. Université Paris-Saclay, 2020. English. ⟨NNT : 2020UPASS024⟩. ⟨tel-02890467⟩

    Année de publication 2020

    Disponible en libre accès

  • Communication dans un congrès

    Nicolas Férey, Pierre-Emmanuel Gros, Joan Hérisson, Rachid Gherbi. Visual Data Mining of Genomic Databases by Immersive Graph-Based Exploration. GRAPHITE 2005, 3rd International Conference On Computer Graphics and Interactives Techniques In Autralia and Southeast Asia, 2005, Dunedin, New Zealand. pp.4. ⟨hal-00145610⟩

    Année de publication 2005

    Disponible en libre accès

  • Article dans une revue

    Clémentine Decamps, Alexis Arnaud, Florent Petitprez, Mira Ayadi, Aurélia Baurès, et al.. DECONbench: a benchmarking platform dedicated to deconvolution methods for tumor heterogeneity quantification. BMC Bioinformatics, 2021, 22 (1), pp.473. ⟨10.1186/s12859-021-04381-4⟩. ⟨hal-03372668⟩

    AO

    Année de publication 2021

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  • Article dans une revue

    Louise Deleger, Fiammetta Namer, Pierre Zweigenbaum. Morphosemantic parsing of medical compound words: Transferring a French analyzer to English. International Journal of Medical Informatics, Elsevier, 2009, 78 (1), pp.48-55. ⟨hal-00413362⟩

    Année de publication 2009

  • Thèse

    Annelyse Thévenin. Aspects algorithmiques des réarrangements génomiques : duplications et ordres partiels. Bio-informatique [q-bio.QM]. Université Paris Sud - Paris XI, 2009. Français. ⟨NNT : 2009PA112194⟩. ⟨tel-00768996⟩

    BioInfo

    Année de publication 2009

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  • Thèse

    Cyril Grouin. Anonymisation de documents cliniques : performances et limites des méthodes symboliques et par apprentissage statistique. Bio-informatique [q-bio.QM]. Université Pierre et Marie Curie - Paris VI, 2013. Français. ⟨tel-00848672⟩

    Année de publication 2013

    Disponible en libre accès