RECAF – Recombinaison et impacts évolutifs du sexe facultatif sur la diversité génétique

Date de début :

Date de fin :

Budget : 376 436 €

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Fanny Pouyet

BioInfo

RECAF aborde de manière originale une question clé de la biologie évolutive : comment le sexe façonne-t-il la diversité génétique ? La reproduction sexuée par le biais de la méiose crée de la variation génétique, mais de nombreuses espèces ont tendance à se reproduire de manière asexuée. En fait, la plupart des organismes unicellulaires, peuvent alterner entre reproduction sexuée et asexuée en fonction du stress environnemental et de la disponibilité des nutriments. Cependant, nous ignorons toujours comment cet équilibre influence les résultats de l'évolution. Je propose d'explorer le rôle du caractère facultatif du sexe, qui permet aux organismes de passer d'un mode de reproduction à l'autre. Mon hypothèse est que la fréquence de la reproduction sexuelle – connue sous le nom de « fréquence méiotique » - est cruciale pour façonner la diversité génétique, en particulier lorsque les taux de recombinaison et les pressions de sélection varient. En utilisant S. cerevisiae, une espèce sexuée facultative où la méiose ne se produit qu'une fois toutes les 500 à 10 000 générations, RECAF étudiera comment la recombinaison, la sélection et la conversion génétique biaisée vers GC façonnent la diversité génomique. Le projet remettra en question les modèles actuels de génétique des populations et offrira de nouvelles perspectives sur la manière dont les stratégies de reproduction et la structure génétique influencent l'évolution. RECAF combinera des modèles théoriques, l'apprentissage automatique et la bio-informatique pour découvrir comment le sexe et la liaison génétique agissent sur la diversité. RECAF permettra d'approfondir notre compréhension de l'évolution et d'améliorer les prévisions relatives à la diversité génétique en cas de changements environnementaux. Les résultats permettront également d'élaborer des stratégies de conservation pour les espèces menacées, contribuant ainsi à la gestion de la biodiversité et à la viabilité à long terme des populations.